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赛默飞ABI Ion GeneStudio S5基因测序仪主要性能
• 无需复杂的光路系统, Ion Torrent半导体测序技术利用天然核苷酸反应, 实现高精度的变异捕获、 极其均一的覆盖度以及高度的检测灵敏度来探测低频变异。
• 相比市场上其他基于光学检测技术的测序平台, IonS5系统帮助希望引入新一代测序技术的实验室降低初期投入成本。
• 支持多种不同价格和通量的半导体芯片(Ion 510™、Ion 520™、 Ion 530™和Ion 540™芯片), 从而为用户开展各类DNA/RNA测序应用项目提供更大的灵活性。
• 提供快的新一代测序仪运行速度。
• 依托用户与技术开发者社区-Ion社区(IonCommunity)-这一社区目前已拥有超过3万名会员,会员人数仍在每天增长中。
• 较小的桌面占用空间, 仅需不到0.5平方米 (仪器尺寸:54.2 x 80.6 x 50.9 cm) 。
• 提供广泛的文库制备方案与试剂盒选择, 操作简单、快速, 起始样品需求量极低, 适用于微生物测序、靶向基因测序、 外显子组测序, 以及RNA测序等广泛研究应用。
• 与Ion Chef™系统或Ion OneTouch™ 2系统配合使用, 实现简易快速的模板制备。
• 通过整合的T630服务器与Torrent Suite™软件, 实现从碱基识别到变异解析的完整解决方案。
• 运用Ion Reporter™软件对配对样品DNA变异的检测和分析, 提供简易和整合的三级数据分析工具。
赛默飞ABI Ion GeneStudio S5基因测序仪技术参数与应用
性能 | 描述 |
简捷的靶向测序流程 | "简单、 快速的自动化工作流程: 靶向测序应用中, 从DNA样品输入到获 得分析数据*的完整过程中手工操作不到45分钟" |
• 文库制备: – Ion Xpress Plus片段文库试剂盒: 15分钟(手工操作时间) – 使用AB Library Builder实验方案实现自动化文库制备(13份样品): 10分钟(手工操作时间) – Ion AmpliSeq靶向富集和建库技术: • 手动建库方案: 60分钟(手工操作时间) • Ion Chef系统自动化建库方案: 15分钟(手工操作时间) • 模板制备: – Ion OneTouch 2系统: 模板扩增, 手工操作时间2.5小时 – Ion Chef系统: 模板扩增与芯片上样, 手工操作时间15分钟 • 测序: – 手工操作时间少于15分钟 • 数据分析: – 从5百万读值数据(200 bp测序反应)获得比对好的BAM文件, 操作时间不到5小时" | |
快速的新一代测序 | 从DNA样品到获得变异结果快仅需两个工作日(8小时计算) |
• 测序反应仅需2.5-4小时即可完成
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高度灵活的通量 | 四款芯片分别提供从2百万至8千万的序列通量, 用户可以根据需求灵活选择 |
每周样品通量高 | 每周可完成更多数量样品的完整靶向测序工作流程 |
• 模块化工作流程设计, 支持用户每周(5个工作日)进行多次测序*: 每台Ion S5系统每周可完成多达10次测序(200碱基读值) • 模块化工作流程, 研究人员能够在一台Ion S5系统上多可同时操作384份标记样品, 每周多可检测3840份独立DNA样品 * 工作日以8小时计算。 | |
简捷、 直观的系统 | 盒装试剂与友好的用户界面, 为用户提供一个简捷的测序流程 |
• 在Ion Chef系统、 Ion OneTouch 2系统和Ion S5系统上, 用户可使用直观的触摸界面进行编程和操控 • 用户可通过固定或移动设备(如iOS和Android设备)远程监控Ion S5测序仪 • 行业标准数据格式(FASTQ、 SFF、 BAM、 VCF), 兼容第三方生物信息学软件提供的下游分析和可视化工具。 • 模块化工作流程, 可在文库制备到测序的每一个环节中实施质量控制, 帮助用户节约时间, 降低试剂成本。 • 通过盒装试剂与完整样品跟踪功能(RFID扫描)优化流程, 提高效率 | |
长碱基读长 | • 200-、 400-与600-碱基读长 • 兼容长mate-pair读长 |
先进硬件 | 牢固而简洁的硬件值得您信赖 |
• 设计简单, 无冗余的活动零件或复杂的附属系统, 稳健可靠 • 标准台式系统(Ion S5系统与Ion Chef系统或Ion OneTouch 2系统), 提供完整扩增与测序工作流程 • 用户可通过Ion S5系统的外置条码阅读器追溯芯片和样品, 通过Ion S5 Torrent服务器实现样品登记 • Ion Chef系统与Ion S5系统采用了优的识别系统, 对编码耗材进行识别和追踪, 并将信息集成至Torrent Suite软件和/或LIMS系统 • 所有Ion S5系统均由符合ISO 13485标准的工厂生产 | |
紧凑型台式系统 | Ion S5 XL系统仅占用很小的桌面空间 |
• 尺寸(W x D x L) (近似值): 21.4 x 31.75 x 20 in. (54.2 x 80.6 x 50.9 cm) • 占用面积: 4.72 平方英尺 • 重量(近似值): 140 lb/63.5 kg | |
提供完整产品组合 | 高性价比的新一代测序平台, 广泛适用于各类DNA与RNA研究应用 |
低序列偏性 | 高度均一的覆盖度及精确的变异检测 |
• Ion 510/520/530 Kit-Chef与Ion 520/530 Kit-OT2能够对200和400碱基文库进行精确、 可靠的测序 • Ion 540 Kit-Chef与Ion 540 Kit-OT2能够对200碱基文库进行精确、 可靠的测序 • Ion 520/530 ExT Kit-Chef能够对600碱基文库进行精确、 可靠的测序 • 通过简单的天然化学反应过程获得均一的覆盖度(即无偏性) • 基于天然核苷酸, 聚合酶或核苷酸上无附着的荧光基团, 从而实现长碱基读长和碱基识别的高保真度 |